Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
EPDR1Q9UM22 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPDR1Q9UM22 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms