Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FZD4Q9ULV1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms