Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C3orf18Q9UK00 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms