Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms