Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF4Q9NR80 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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