Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNB1IP1Q9NPC3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms