Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GANQ9H2C0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms