Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP62CLQ9H1M0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms