Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms