Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA1CQ9BQE3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms