Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms