Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms