Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00301Q8NCQ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms