Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms