Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF554Q86TJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF554Q86TJ5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF554Q86TJ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF554Q86TJ5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms