Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NPM2Q86SE8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms