Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms