Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL54Q6P161 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL54Q6P161 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms