Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms