Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT6Q5T7P8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT6Q5T7P8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms