Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR4Q5GH76 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms