Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDCA8Q53HL2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms