Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL22Q53GT1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms