Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 NGEF-209ENST00000489127 590 ntTSL 514.27□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 214.27□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC1B-215ENST00000468337 890 nt14.23□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZBTB17-208ENST00000472658 591 ntTSL 314.23□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RABGGTA-211ENST00000559850 534 ntTSL 314.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-211ENST00000473619 932 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-213ENST00000488669 887 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-205ENST00000591070 473 ntTSL 314.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-206ENST00000562912 569 ntTSL 414.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DUSP3-202ENST00000590342 2077 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SUCLA2-209ENST00000497202 902 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SUCLA2-203ENST00000434484 894 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-208ENST00000471880 785 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-207ENST00000548887 568 ntTSL 414.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 IMPDH2-212ENST00000496837 760 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-207ENST00000480197 554 ntTSL 414.03□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBAP2-202ENST00000379225 1809 ntTSL 214.01□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC1B-210ENST00000445924 727 ntTSL 513.97□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-212ENST00000570215 994 ntTSL 313.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-205ENST00000562519 1790 ntTSL 213.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-215ENST00000540792 951 ntTSL 213.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAGK-214ENST00000478659 677 ntTSL 313.86□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MMP25-AS1-202ENST00000572222 410 ntTSL 313.86□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-231ENST00000600201 694 ntTSL 513.85□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR2F-210ENST00000484894 551 ntTSL 413.83□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CORO1B-209ENST00000616321 4464 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 L3MBTL2-207ENST00000479978 5875 ntTSL 213.82□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-210ENST00000491478 758 ntTSL 513.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MUTYH-226ENST00000482094 920 ntTSL 213.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-207ENST00000471724 443 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-219ENST00000478564 555 ntTSL 413.76□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-205ENST00000594068 841 ntTSL 513.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOC4L-204ENST00000541954 1009 ntTSL 513.66□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-212ENST00000487209 828 ntTSL 213.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KRT19-206ENST00000479031 427 ntTSL 213.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NGEF-207ENST00000424488 569 ntTSL 313.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-211ENST00000439456 762 ntTSL 413.61□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CERCAM-204ENST00000420034 551 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-203ENST00000416938 3408 ntTSL 213.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-225ENST00000635546 1115 ntTSL 513.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC009119.2-202ENST00000563312 458 ntTSL 213.55□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNTROB-212ENST00000576538 784 ntTSL 513.55□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-215ENST00000637657 2118 ntTSL 513.55□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SLC26A11-210ENST00000572226 623 ntTSL 313.5□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STUB1-203ENST00000564316 729 ntTSL 313.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DYNC1H1-209ENST00000556229 582 ntTSL 213.47□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC1B-208ENST00000432343 839 ntTSL 513.47□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-205ENST00000430300 1470 ntTSL 513.46□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-208ENST00000439416 921 ntTSL 513.45□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHF12-217ENST00000589176 869 ntTSL 513.43□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-204ENST00000503231 450 ntTSL 413.42□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-208ENST00000378258 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PRMT1-214ENST00000529836 580 ntTSL 313.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VTI1A-209ENST00000496445 853 ntTSL 213.38□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-206ENST00000440484 781 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZBTB17-207ENST00000471805 544 ntTSL 213.37□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CFLAR-213ENST00000441224 655 ntTSL 313.37□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-211ENST00000551351 532 ntTSL 413.35□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-212ENST00000491833 921 ntTSL 313.33□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-224ENST00000583785 1135 ntTSL 213.29□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DPAGT1-209ENST00000472016 568 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DRG2-218ENST00000582528 5342 ntTSL 213.29□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-209ENST00000479439 646 ntTSL 513.27□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-226ENST00000598932 575 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-214ENST00000596507 1014 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 41.9
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