Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPARCL1Q14515 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCL1Q14515 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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