Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTB1Q13884 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTB1Q13884 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms