Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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