Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms