Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5BP61020 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5BP61020 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms