Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN1P49257 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms