Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms