Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YY1P25490 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YY1P25490 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YY1P25490 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YY1P25490 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YY1P25490 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
YY1P25490 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YY1P25490 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YY1P25490 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YY1P25490 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms