Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms