Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LYPD3O95274 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LYPD3O95274 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms