Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOL3O95236 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOL3O95236 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOL3O95236 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOL3O95236 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOL3O95236 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms