Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIOO75962 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIOO75962 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIOO75962 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIOO75962 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIOO75962 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIOO75962 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms