Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KIAA0556O60303 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms