Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSTPIP1O43586 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms