Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBFA2T2O43439 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms