Protein–RNA interactions for Protein: O43423

ANP32C, Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member C, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANP32CO43423 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANP32CO43423 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANP32CO43423 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms