Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QKU1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QKU1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QKU1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QKU1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QKU1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QKU1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QKU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QKU1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QKU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3QKU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms