Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DEV8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DEV8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
B4DEV8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
B4DEV8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
B4DEV8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DEV8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms