Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C5orf51A6NDU8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms