Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
A0A0U1RRA0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
A0A0U1RRA0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms