Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVW-1Q9UQF0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms