Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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