Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-7■■■□□ 15.2
SLTMQ9NWH9 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.244e-7■■■□□ 15.2
SLTMQ9NWH9 SLC17A9-207ENST00000488738 3992 ntTSL 213.52□□□□□ -0.254e-7■■■□□ 15.2
SLTMQ9NWH9 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 212.37□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 36.5□□□□□ -1.371e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.641e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SP5-202ENST00000487037 257 ntTSL 317.65■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 414.77□□□□□ -0.051e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.832e-12■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 NEU4-206ENST00000415936 860 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-7■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 NEU4-208ENST00000423583 753 ntTSL 518.33■□□□□ 0.523e-7■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 TANGO2-222ENST00000479679 894 ntTSL 225.13■■□□□ 1.614e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 TANGO2-219ENST00000471707 745 ntTSL 516.56■□□□□ 0.244e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 317.13■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 516.19■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP3-202ENST00000412256 558 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 210.49□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SDC1-205ENST00000447124 591 ntTSL 421.48■■□□□ 1.035e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SDC1-204ENST00000429035 646 ntTSL 314.96□□□□□ -0.015e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.055e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 UNK-208ENST00000592629 633 ntTSL 317.7■□□□□ 0.427e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 NOL4L-208ENST00000475781 1127 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.45e-9■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.175e-9■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.047e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-9■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 ACSL3-203ENST00000407441 538 ntTSL 36.13□□□□□ -1.435e-9■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 415.37■□□□□ 0.056e-8■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 315.83■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 313.53□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 15.1
SLTMQ9NWH9 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 412.85□□□□□ -0.358e-9■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 210.2□□□□□ -0.788e-9■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 422.84■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 417.72■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.52■■□□□ 1.521e-6■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 HDAC4-213ENST00000496347 995 ntTSL 316.29■□□□□ 0.23e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 HS6ST1-203ENST00000469019 559 ntTSL 415.66■□□□□ 0.17e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.247e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.966e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.396e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.286e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.356e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-244ENST00000617454 582 ntTSL 311.21□□□□□ -0.616e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.946e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -16e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -16e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-10■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 SLC2A9-204ENST00000503280 584 ntTSL 47.89□□□□□ -1.153e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 SLC2A9-212ENST00000512342 967 ntTSL 37.82□□□□□ -1.163e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 SLC2A9-205ENST00000503803 644 ntTSL 37.23□□□□□ -1.253e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.35■□□□□ 0.692e-6■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 215.65■□□□□ 0.16e-7■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 MAP3K11-203ENST00000524856 3787 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 315.82■□□□□ 0.127e-8■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 225.66■■□□□ 1.71e-6■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.473e-8■■■□□ 15
SLTMQ9NWH9 ZNF69-201ENST00000340180 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-7■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 419.36■□□□□ 0.697e-8■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 215.82■□□□□ 0.127e-8■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.173e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 DUSP9-203ENST00000477033 430 ntTSL 320.8■□□□□ 0.923e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC12.27□□□□□ -0.458e-7■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.911e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.591e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 CYHR1-206ENST00000526887 1012 ntTSL 317.98■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 413.32□□□□□ -0.288e-9■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.451e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.582e-7■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 BAIAP2-222ENST00000575841 509 ntTSL 213.07□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 413.02□□□□□ -0.338e-9■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 AC139887.2-203ENST00000503185 618 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-8■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 AC139887.2-204ENST00000503405 550 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-8■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 NEU4-207ENST00000420288 845 ntTSL 319.92■□□□□ 0.784e-7■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 NEU4-209ENST00000426032 676 ntTSL 316.75■□□□□ 0.274e-7■■■□□ 14.9
SLTMQ9NWH9 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 516.19■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 14.8
SLTMQ9NWH9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.499e-7■■■□□ 14.8
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