Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms