Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUFT1Q9NNX1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms