Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM5Q9C035 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms